教育背景

1. 2009/10-2011/10，德国明斯特大学，分子微生物技术研究所，联合培养博士

2. 2006/09-2012/07，山东大学，微生物技术国家重点实验室，博士

3. 2002/09-2006/07，山东大学，国家生命科学和技术基地班，学士

工作经历

1. 2019/09- 至今， 山东大学“齐鲁青年学者”，微生物技术国家重点实验室，教授（破格）

2. 2018/09 –2019.08， 山东大学，微生物技术国家重点实验室，副教授

3. 2012/07- 2018.09，山东大学，微生物技术国家重点实验室，讲师

4. 2012/07- 2014/07，山东大学，化学与化工学院，博士后

科研工作简介

主要研究方向有二，包括异养菌硫代谢研究以及合成生物学应用研究。两者互为依托，提出了创新理论和技术：1.扩展了异养菌硫代谢理论的内涵。通过建立新生物信息学分析策略，对SQR-PDO的硫氧化途径在微生物界的分布情况进行了分析，最终为异养细菌参与硫元素地球生物化学循环提供了重要证据和理论补充。2.还探索了异养菌硫代谢的中间产物硫烷与细胞氧化还原稳态形成及重要生理代谢密切调控关系。未来，希望继续深入研究，最终可以阐明硫烷和H₂S对细胞生理过程施加影响的具体方面及作用机制。3.在合成生物学技术领域取得原创成果。纠正了经典定点突变技术理论；并基于新理论，建立高效的定点突变和分子克隆技术，使其成本比现有技术成本低100倍以上，达到了商业化的水平。革新了大肠杆菌转化方法，将现有转化效价提升到了商业化的水平。4.借助合成生物学手段改造肠道益生菌构建疾病治疗菌剂。成功构建了可以在肠道中快速降解尿酸的工程益生菌，缓解了急性小鼠高尿酸血症模型的血尿酸水平，该研究有工业化前景。其他治疗菌株也在构建中。

相关工作在ISME J.、Nucleic Acids Res.(2篇)、Gut Microbes、Redox Biology、Anal Chem.、Appl Environ Microbiol等期刊上发表第一/通讯作者SCI论文19篇，其中5篇发表在公认Top期刊上（IF>10），其他都在领域内二区及以上期刊上发表。另出版专著章节一章。作为主持人获得国家课题资助2项，省级课题资助1项。作为子课题负责人申请到国家课题3项，科研总经费达到168.5万。2019年成功入选山东大学青年学者未来计划。2021年成功入选山东大学齐鲁青年学者项目。

课题>项目

1. 国家自然科学基金面上项目，31870085，一条新型异养细菌H2S氧化途径的调控和代谢机制研究，59万，在研，主持；

2. 国家自然科学基金重大研究计划，近海沉积物中硫氧化主要菌群与关键通路的研究，30万，在研，子课题负责人；

3. 国家重点研发计划，基于成药性特征的微生物天然产物合成生物学创制，18万，在研，子课题负责人；

4. 国家自然基金国际(地区)合作与交流项目，31961133015,合成塑料降解转化微生物菌群，60万，在研，子课题负责人；

5. 国家自然科学基金青年项目，31500047，QuikChange^TM定点突变中具有同源末端线性DNA分子形成机制的研究，20万，已结题，主持；

6. 山东省博士基金，2015BSE27054，DNA聚合酶的链置换活性在QuikChange^TM定点突变中的作用及新应用，8万，已结题，主持。

论文

1. Mingxue Ran, Qingbin Li, Yufeng Xin, Shaohua Ma, Rui Zhao, Min Wang, Luying Xun*,Yongzhen Xia*, Rhodaneses minimize the accumulation of cellular sulfane sulfur to avoid disulfide stress during sulfide oxidation in bacteria, Redox Biology, 2022 Jul; 53: 102345. (5 year IF=11.271，一区)

2. Rui Zhao, Zimai Li, Yuqing Sun, Wei Ge, Mingyu Wang, Huaiwei Liu, Luying Xun,Yongzhen Xia*，EngineeredEscherichia coliNissle 1917 with urate oxidase and an oxygen-recycling system for hyperuricemia treatment，Gut Microbes，2022 Jan-Dec; 14(1):2070391. (5 year IF=11.724，一区)

3. Xia Yongzhen, Li Kai, Li Jingjing, Wang Tianqi, Gu Lichuan*, Xun Luying*. T5 exonuclease-dependent assembly offers a low-cost method for efficient cloning and site-directed mutagenesis, Nucleic Acids Res., 2019, 47(3):e15 (5 year IF=17.21,一区)

4. Yongzhen Xia, Chuanjuan Lü, Ningke Hou,Yufeng Xin,Jihua Liu, Honglei Liu*, Luying Xun*, Sulfide production and oxidation by heterotrophic bacteria under aerobic conditions. ISME J., 2017, Dec;11(12):2754-2766. (5 year IF=13.214，一区)

5. Yongzhen Xia, Wenqiao Chu, Qingsheng Qi, Luying Xun*, New insights into the QuikChange^TMprocess guide the use of Phusion DNA polymerase for site-directed mutagenesis,Nucleic Acids Res., 2015, 43(2):e12 (5 year IF=17.21，一区)

6. Huangwei Xu^#, Guanhua Xuan^#, Huaiwei Liu, Honglei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*, Sulfane Sulfur Is an Intrinsic Signal for the Organic Peroxide Sensor OhrR ofPseudomonas aeruginosa, Antioxidants (Basel). (Accepted, 5 year IF=7.886,二区Top)

7. Qiaoli Yu, Mingxue Ran, Yuqing Yang, Huaiwei Liu, Luying Xun*,Yongzhen Xia*, Optimization of a Method for Detecting Intracellular Sulfane Sulfur Levels and Evaluation of Reagents That Affect the Levels inEscherichia coli, 2022 Jul; 11(7): 1292., Antioxidants (Basel). (5 year IF=7.886,二区Top)

8. Yuqing Yang, Qiaoli Yu, Min Wang, Rui Zhao, Huaiwei Liu, Luying Xun,Yongzhen Xia*,Escherichia coliBW25113 Competent Cells Prepared Using a Simple Chemical Method Have Unmatched Transformation and Cloning Efficiencies, Front Microbiol., 2022 Mar 24;13:838698. (5 year IF=6.843,二区Top)

9. Tianqi Wang, Yuqing Yang, Menghui Liu, Honglei Liu, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*,Elemental Sulfur Inhibits Yeast Growth via Producing Toxic Sulfide and Causing Disulfide Stress, Antioxidants (Basel)., 2022 Mar 17;11(3):576. (5 year IF=7.886,二区Top)

10. Tianqi Wang, Mingxue Ran, Xiaoju Li, Yequn Liu, Yufeng Xin, Honglei Liu, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*, The Pathway of Sulfide Oxidation to Octasulfur Globules in the Cytoplasm of Aerobic Bacteria, Appl Environ Microbiol., 2022 Feb 8;88(3): e0194121. (5 year IF=5.632,二区Top)

11. Huangwei Xu, Guanhua Xuan, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*,Sulfane Sulfur Is a Strong Inducer of the Multiple Antibiotic Resistance Regulator MarR inEscherichia coli, Antioxidants (Basel)., 2021 Nov 6;10(11):1778. (5 year IF=7.886,二区Top)

12. Guanhua Xuan, Chuanjuan Lv, Huangwei Xu, Kai Li, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*, Sulfane Sulfur Regulates LasR-Mediated Quorum Sensing and Virulence inPseudomonas aeruginosaPAO1,Antioxidants (Basel)., 2021 Sep 21;10(9):1498. (5 year IF=7.886,二区Top)

13. Yuqing Yang, Tianqi Wang, Qiaoli Yu, Huaiwei Liu, Luying Xun,Yongzhen Xia*, The pathway of recombining short homologous ends inEscherichia colirevealed by the genetic study, Mol Microbiol., 2021 Jun;115(6):1309-1322. (5 year IF=4.157,二区)

14. Yufeng Xin, Rui Gao, Feifei Cui, Chuanjuan Lü, Honglei Liu, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*, The Heterotrophic Bacterium Cupriavidus pinatubonensis JMP134 Oxidizes Sulfide to Sulfate with Thiosulfate as a Key Intermediate,Appl Environ Microbiol.,2020 Oct 28;86(22):e01835-20. (5 year IF=5.632,二区Top)

15. Guanhua Xuan, Chuanjuan Lü, Huangwei Xu, Zhigang Chen, Kai Li, Honglei Liu, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luying Xun*, Sulfane Sulfur is an intrinsic signal activating MexR-regulated antibiotic resistance inPseudomonas aeruginosa, Mol Microbiol., 2020 Dec;114(6):1038-1048. (5 year IF=4.157,二区)

16. Ran Mingxue, Wang Tianqi, Shao Ming, Chen Zhigang, Liu Huaiwei,Xia Yongzhen*, Xun Luying*，Sensitive Method for Reliable Quantification of Sulfane Sulfur in Biological Samples, Anal Chem. 17;91(18):11981-11986 (5 year IF=7.528，共同通讯，一区)

17. Liu Huaiwei, Fan Kaili, Li Huanjie, Wang Qingda, Yang Yunyun, Li Kai,Xia Yongzhen*, Xun Luying*，Synthetic Gene Circuits Enable Escherichia coli To Use Endogenous H2S as a Signaling Molecule for Quorum Sensing, ACS Synth Biol. 20;8(9):2113-2120.(5 year IF=5.373，共同通讯，二区Top)

18. Chen Zhigang, Zhang Xi, Li Huanjie, Liu Huaiwei,Xia Yongzhen^#, Xun Luying^#, The Complete Pathway for Thiosulfate Utilization in Saccharomyces cerevisiae. Appl Environ Microbiol. 2018 Oct 30;84(22). (5 year IF=5.632,共同通讯，二区Top)

19. Kai Li, Yufeng Xin, Guanhua Xuan, Rui Zhao, Huaiwei Liu,Yongzhen Xia*, Luyng Xun*.Escherichia coliuses different enzymes to produce H2S and reactive sulfane sulfur from L-cysteine, Front Microbiol.,2019 Feb 20;10:298. (5 year IF=6.843,共同通讯，二区Top)