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北京大学郭立研究员应邀做客山海知微

2024年07月01日 作者:郝兴坤编辑:侯煜审核:张伶俐浏览量 :

6月27日上午,北京大学现代农业研究院郭立研究员受微生物技术国家重点实验室卞小莹教授邀请,做客“山海知微”系列学术论坛,作了题为“辣椒T2T基因组与辣椒素合成通路进化”的学术报告。本次报告由卞小莹主持。

郭立首先介绍了辣椒是我国第一大蔬菜作物,由此引出本次报告内容辣椒素。辣椒素生物合成有两个特异性,物种特异性与时空特异性,即辣椒素只在辣椒属植物中合成,只在果实胎座合成。针对这两个特异性,郭立团队开展了一系列工作。首先对辣椒的基因组进行了测序,成功组装了两个辣椒的端粒到端粒(T2T)的无缺口基因组序列,然后对基因进行标注,并筛选与辣椒素生物合成的相关基因CS基因。分析辣椒素在不同植物中的进化发现,关键合成基因CS 只存在于茄科植物中,辣椒属中Ca含有最多的CS 功能基因拷贝,郭立进一步解释了都含有辣椒素的植物有的辣有的不辣是因为不辣的植物其CS基因发生了变异或调控序列缺失,基因上下游的结构变异导致辣椒素只在辣椒中合成,其他茄科植物不能合成。通过多组学数据联合分析,发现了辣椒素关键基因和转录因子的胎座特异性调控序列,解释了辣椒素合成途径的组织特异性机制。

接下来郭立介绍了其团队对辣椒着丝粒的研究,发现辣椒着丝粒缺乏串联重复序列,Gypsy-LTR转座子插入导致其快速进化,T2T基因组改进了变异检测分析。同时郭立课题组构建了机器学习模拟,基于CNV分析预测辣椒的辣度,能够用于苗期快速评估辣椒素含量,从而缩短育种周期。

最后,大家针对辣椒素提出了各自感兴趣的问题,郭立耐心地为大家答疑解惑,并且与在场的师生展开了深入的讨论,大家在此次讲座中受益匪浅。

郭立,北京大学现代农业研究院研究员、课题组长(PI)。山东省“杰青”项目、“泰山学者”青年专家项目获得者,美国宾夕法尼亚州立大学博士学位,美国UMASS Amherst 博士后,长期从事园艺作物基因组学、天然产物的生物合成途径与异源合成。主导完成多个重要作物的复杂基因组序列的破译,揭示关键次生代谢通路的演化历史,解析了天然产物生物合成通路,助力开发天然产物高效生物合成细胞工厂和作物品质改良。现已发表SCI论文40余篇,包括以第一作者或通讯作者身份发表在Science、PNAS、Nature Communications、New Phytologist等多个国际著名期刊上;现担任MPMI副主编,Plant Physiology and Biochemistry期刊客座编辑;为多个国际权威期刊审稿200余次,被评为2022年度中国科技期刊卓越行动计划优秀审稿人。