微生物学、生物化学与分子生物学

徐菲

副研究员
硕士生导师
0531-88362590
个人简介 科研项目 学术论文 其他介绍

教育背景

博士 起止时间:2013-2018,毕业院校:山东大学,专业:微生物学

学士 起止时间:2009-2013,毕业院校:山东大学(威海),专业:生物技术


工作经历

起止时间 单位名称 专业技术职务

2018-2021 山东大学微生物技术研究院 博士后

2021-至今 山东大学微生物技术研究院 副研究员


研究方向:

海洋微生物学


研究内容:

1.海洋微生物对海洋多糖的降解过程与机制

2.新型海洋微生物来源多糖降解酶的挖掘、蛋白结构及作用机制研究;

3.海洋微生物多糖降解酶的应用


1.海洋细菌PL34家族褐藻胶裂解酶的催化机制及分子改造。

(国家自然基金面上项目,2023-2026,54万元,主持)

2.海洋细菌PL36家族褐藻酸裂解酶的性质、结构和催化机制。

(博士后科学基金面上项目,2019-2021,5万元,主持)

3.海洋微生物来源的PL7褐藻酸裂解酶新亚家族的发现及其性质、结构、催化机制和底物特异性的分子基础研究。

(青岛市博士后应用项目,2019-2021,5万元,主持)

4.2018年博士后创新人才支持计划,60万元,主持


代表性论文

1.Sun XH, Chen XL, Wang XF, Zhang XR, Sun XM, Sun ML, Zhang XY, Zhang YZ, Zhang YQ*, Xu F*. Cost-effective production of alginate oligosaccharides from Laminaria japonica roots by Pseudoalteromonas agarivorans A3. Microb Cell Fact. 2023, 22(1):179.

2.Wang XH, Sun XH, Chen XL, Li PY, Qin QL, Zhang YQ*, Xu F*. Synergy of the Two Alginate Lyase Domains of a Novel Alginate Lyase from Vibrio sp. NC2 in Alginate Degradation. Appl Environ Microbiol. 2022, 88(23):e0155922.

3.Xue Z, Sun XM, Chen C, Zhang XY, Chen XL, Zhang YZ, Fan SJ*, Xu F*. A Novel Alginate Lyase: Identification, Characterization, and Potential Application in Alginate Trisaccharide Preparation. Mar Drugs. 2022, 20(3):159.

4.Xu F#, Dong F#, Sun XH, Cao HY, Fu HH, Li CY, Zhang XY, McMinn A, Zhang YZ, Wang P, Chen XL*. Mechanistic Insights into Substrate Recognition and Catalysis of a New Ulvan Lyase of Polysaccharide Lyase Family 24. Appl Environ Microbiol. 2021,87(12):e0041221.

5.Xu F#, Cha QQ#, Zhang YZ, Chen XL. Degradation and Utilization of Alginate by Marine Pseudoalteromonas: a Review. Appl Environ Microbiol. 2021, 87(17):e0036821.

6.Cheng JH, Zhang XY, Wang Z, Zhang X, Liu SC, Song XY, Zhang YZ, Ding JM, Chen XL*, Xu F*. Potential of Thermolysin-like Protease A69 in Preparation of Bovine Collagen Peptides with Moisture-Retention Ability and Antioxidative Activity. Mar Drugs. 2021, 19(12):676.

7.Cha QQ, Wang XJ, Ren XB, Li D, Wang P, Li PY, Fu HH, Zhang XY, Chen XL, Zhang YZ, Xu F*, Qin QL*. Comparison of Alginate Utilization Pathways in Culturable Bacteria Isolated From Arctic and Antarctic Marine Environments. Front Microbiol. 2021, 12:609393.

8.Xu F#, Chen XL#, Sun XH, Dong F, Li CY, Li PY, Ding H, Chen Y, Zhang YZ, Wang P*. Structural and molecular basis for the substrate positioning mechanism of a new PL7 subfamily alginate lyase from the arctic. J Biol Chem. 2020, 295(48):16380-16392.

9.Xu F, Dong F, Wang P, Cao HY, Li CY, Li PY, Pang XH, Zhang YZ, Chen XL. Novel molecular insights into the catalytic mechanism of marine bacterial alginate lyase AlyGC from polysaccharide lyase family 6. J Biol Chem. 2017, 292(11):4457-4468.

10.Xu F, Wang P, Zhang YZ, Chen XL. Alginate Lyases: Diversity of Three Dimensional Structures and Catalytic Mechanisms. Appl Environ Microbiol. 2017, 17;84(3):e02040-17

所获专利

1.张玉忠,徐菲,刘扬,王小涵,陈秀兰,张霞.一种高效表达褐藻酸裂解酶的基因工程菌及其构建方法与应用, 202210175704.7, 2022.2.25,ZL202210175704.7,2023.9.15

2.张玉忠,徐菲,刘扬,孙晓慧,张霞,陈秀兰.一株生产褐藻胶裂解酶的枯草芽孢杆菌突变株及其构建方法与应用, 202210175702.8, 2022.2.25,ZL202210175702.8,2023.9.15